Резюме

Мишко М.Ю., Кушнаренко Н.Н., Медведева Т.А.

АНАЛИЗ МЕЖГЕННЫХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЙ, ПРЕДРАСПОЛАГАЮЩИХ К РАЗВИТИЮ ПОДАГРЫ В ПОПУЛЯЦИИ РУССКИХ ЗАБАЙКАЛЬСКОГО КРАЯ

Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования Читинская государственная медицинская академия Минздрава России, 672000, г. Чита, ул. Горького, 39а

Цель исследования. Изучитьхарактер мультилокусных взаимодействий генов MTHFR С677T, MTHFR А1298G, MTR А2756G, MTRR А66G, APEX1 Т444G, ABCG2 C421A у больных подагрой в популяции русских Забайкальского края.

Материалы и методы. Обследовано 80 пациентов (69 мужчин и 11 женщин) с подагрой. Диагноз подагры выставлен согласно классификационным критериям ACR/EULAR, 2015. Контрольную группу составили 46 здоровых лиц соответствующего возраста. По национальной принадлежности все обследуемые являлись русскими, родившимися и проживающими на территории Забайкальского края. Материалом для исследования являлась ДНК, выделенная из лейкоцитов цельной периферической крови. Все пациенты были генотипированы для выявления полиморфизмов генов фолатного цикла – MTHFR С677T, MTHFR А1298G, MTR А2756G, MTRR А66G, гена APEX1 Т444G и гена, кодирующего уратные транспортеры и ассоциированного с транспортом аллопуринола (ABCG2 C421A rs2231142). Анализ межгенных взаимодействий проведен с использованием модифицированной версии программы редукции мультифакторных пространств (Multifactor Dimentionality Reduction, MDR) GMDR (Generalized Multifactor Dimentionality Reduction). Статистическая обработка данных проводилась с помощью пакета статистических программ Statistica 10,0.

Результаты. Проведенный нами анализ межгенных взаимодействий позволил выявить ключевые ген-генные взаимодействия, предрасполагающие к развитию подагры у представителей русской популяции Забайкальского края. Наиболее оптимальными межгенными моделями оказались двухлокусная модель ABCG2 С421А (rs2231142)APEX1 T444G (p = 0,0107), две трехлокусные модели MTHFRC677TMTRRA66GABCG2 С421А (rs2231142) (p = 0,0107) и MTHFR А1298СABCG2 С421А (rs2231142)APEX1 T444G (p = 0,0107), четырехлокусная модель MTHFRC677MTRRA66GABCG2 С421А (rs2231142)APEX1 T444G (p= 0,001), пятилокусная модель MTHFRC677TMTRA2756G MTRRA66GABCG2 С421А (rs2231142)APEX1 T444G (p= 0,0107).

Заключение.Анализ межгенных взаимодействий позволил выявить ключевые ген-генные взаимодействия, предрасполагающие к развитию подагры у представителей русской этнической принадлежности в популяции Забайкальского края.

Ключевые слова: подагра, мочевая кислота, генетический полиморфизм, MTHFR, MTR, MTRR, APEX1, ABCG2, межгенные взаимодействия.

Mishko M. Yu., Kushnarenko N. N., Medvedeva T. A.

ANALYSIS OF INTERGENIC INTERACTIONS PREDISPOSING TO GOUT AMONG

THE RUSSIAN POPULATION OF THE TRANS-BAIKAL TERRITORY

Chita State Medical Academy, Chita, Russia, 39AGorky str., 672000

Objective. To study the multi-locus interaction pattern of the MTHFR C677T, MTHFR A1298G, MTR A2756G, MTRR A66G, APEX1 T444G, ABCG2 C421A genes in gout patients among the Russian population of the TRANS-Baikal territory.

Materials and methods. 80 patients (69 men and 11 women) with gout were examined. The diagnosis of gout was made according to the classification criteria ACR/EULAR, 2015. The control group consisted of 46 healthy individuals of the corresponding age. All the subjects were Russian by nationality, who were born and live in the TRANS-Baikal territory. The material for the study was DNA isolated from whole peripheral blood leukocytes. All patients were genotyped to identify polymorphisms of the folate cycle genes-MTHFR C677T, MTHFR A1298G, MTR A2756G, MTRR A66G, APEX1 T444G gene and the gene encoding urate transporters and associated with allopurinol transport (ABCG2 C421A rs2231142). The analysis of intergenic interactions was performed using a modified version of the multi-factor space reduction program (Multifactor Dimentionality Reduction, MDR) GMDR (Generalized Multifactor Dimentionality Reduction). Statistical data processing was performed using the statistical software package Statistica 10.0.

Results. The analysis of intergenic interactions revealed key gene interactions that predispose to the development of gout in the Russian population of the TRANS-Baikal territory. The most optimal intergenic models turned out to be the two-locus model ABCG2 С421А (rs2231142)APEX1 T444G (p = 0,0107), two three-locus models MTHFRC677TMTRRA66GABCG2 C421A (rs2231142) (p = 0,0107) and MTHFR A1298CABCG2 C421A (rs2231142)APEX1 T444G (p = 0,0107), four-locus model MTHFRC677MTRRA66GABCG2 C421A (rs2231142)APEX1 T444G (p= 0,001), five-locus model MTHFRC677TMTRA2756G MTRRA66GABCG2 C421A (rs2231142)APEX1 T444G (p= 0,0107).

Conclusion. The analysis of intergenic interactions allowed us to identify the key gene interactions that predispose to the development of gout in representatives of Russian ethnicity in the population of the TRANS-Baikal territory.

Key words: gout, uric acid, genetic polymorphism, MTHFR, MTR, MTRR, APEX1, ABCG2, intergenic interactions.