УЧРЕДИТЕЛЬ: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Читинская государственная медицинская академия» Министерства здравоохранения Российской Федерации
Зарегистрирован в качестве
средства массовой информации
Федеральной службой по надзору
в сфере связи и массовых коммуникаций
Эл № ФС77-34784
от 24 декабря 2008 г.

В 2018 г. в запись о регистрации
внесены изменения и уточнения
Эл № ФС77-73212 от 02 июля 2018 г.
ISSN 1998-6173
АНАЛИЗ АССОЦИАЦИИ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНА РЕПАРАЦИИ ДНК APEX1 С РАЗВИТИЕМ ПОДАГРЫ

Резюме

Название статьиАНАЛИЗ АССОЦИАЦИИ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНА РЕПАРАЦИИ ДНК APEX1 С РАЗВИТИЕМ ПОДАГРЫ
ASSOCIATIONS OF THE APEX1 T444G DNA REPAIR GENE WITH THE GOUT DEVELOPMENT
Категорияномер 1 за 2023 год (опубликован 04.04.2023)
ТипНаучная статья
Ключевые словаподагра, мочевая кислота, генетический полиморфизм, APEX1, гены пуринового обмена, гены репарации ДНК
gout, uric acid, genetic polymorphism, APEX1, purine metabolism genes, DNA repair genes
СкачатьСкачать статью
doi10.52485/19986173_2023_1_62
УДК575.174.015.3:616-002.78
Резюме

Цель исследования. Изучить распределение частот аллелей и генотипов полиморфного локуса T444G rs1130409 гена репарации ДНК APEX1 у больных подагрой и оценить их ассоциацию с вероятностью развития заболевания в популяции русских Забайкальского края.

Материалы и методы. Обследовано 80 пациентов (69 мужчин и 11 женщин) с подагрой. Диагноз подагры выставлен согласно классификационным критериям ACR/EULAR, 2015. Контрольную группу составили 46 здоровых лиц соответствующего возраста. По национальной принадлежности все обследуемые являлись русскими, родившимися и проживающими на территории Забайкальского края. Материалом для исследования являлась ДНК, выделенная из лейкоцитов цельной периферической крови с использованием комплекта реагентов «ДНК-Экспресс Кровь» («Литех», Россия). Все пациенты были генотипированы для выявления полиморфизма локуса T444G rs1130409 гена APEX1. Статистическая обработка данных проводилась с помощью пакета статистических программ Statistica 10,0. Распределение генотипов проверяли на соответствие равновесию Харди-Вайнберга с помощью критерия χ2. Различия по частоте аллелей и генотипов между группами оценены критерием χ2 Пирсона. Для оценки ассоциации генотипов и аллелей с подагрой рассчитаны показатели отношения шансов (Odds Ratio, OR) с оценкой 95%-ного доверительного интервала (Confidence Interval, CI).

Результаты. При исследовании полиморфизма T444G гена APEX1 у больных подагрой обнаружено статистически значимое увеличение частоты гомозиготного генотипа G/G (27,5% против 9%; χ2=6,3; p=0,01; OR=3,98; CI95%=1,28-12,4). В группе больных подагрой мужского пола отмечается более высокая частота мутантного аллеля G по сравнению с контрольной группой (53,6% против 4%; χ2=5,66; р=0,01; OR=2,24; CI95%=1,14-4,40) и статистически значимое уменьшение частоты аллеля Т (46,4% против 96% соответственно; χ2=5,66, р=0,01, OR=0,45, CI95%=0,23-0,87).

Заключение. Обнаружены различия в распределении частот аллелей и генотипов полиморфного локуса APEX1 T444G rs1130409 у больных подагрой и здоровых респондентов. Наличие генотипа G/G повышает вероятность подагры в 3,9 раза. У респондентов мужского пола носительство аллеля дикого типа (T) оказывает протективное влияние, в то время как носительство минорного аллеля было ассоциировано с увеличением вероятности развития заболевания. Полученные данные указывают на возможную роль полиморфизма гена APEX1 T444G rs1130409 в патогенезе развития подагры

Список литературы
1. Сухих Ж.Л., Штонда М.В., Петров С.А., Воробьева Е.П. Подагра: современные аспекты диагностики и лечения. Международные обзоры: клиническая практика и здоровье. 2014. 5(11). 79-89.
2. Денисов И.С., Елисеев М.С., Барскова В.Г. Исходы подагры. Обзор литературы. Часть I. Эпидемиология подагры, факторы риска и течение заболевания с развитием хронической тофусной формы. Проблемы практической ревматологии. 2013. 51(5). 569-573. DOI 10.14412/1995-4484-2013-1550
3. Цурко В.В., Громова М.А., Червякова Ю.Б., Копелев А.А. Гиперурикемия и сердечно-сосудистые заболевания: современные аспекты терапии. Лечебное дело. 2019. 1. 14-19. DOI 10.24411/2071-5315-2019-12085.
4. Денисов И.С., Елисеев М.С., Барскова В.Г. Исходы подагры. Обзор литературы. Часть II. Коморбидные заболевания, риск развития сердечно-сосудистых катастроф и смерти при подагре. Проблемы практической ревматологии. 2013. 51(6). 703-710. DOI 10.14412/1995-4484-2013-703-10.
5. Ледяхова М.В., Насонова С.Н., Терещенко С.Н. Гиперурикемия как предиктор хронической сердечной недостаточности. Рациональная фармакотерапия в кардиологии. 2015. 11(4). 355-358. DOI 10.20996/1819-6446-2015-11-4-355-358
6. Singh J.A., Gaffo A. Gout epidemiology and comorbidities/ Semin Arthritis Rheum. 2020. 50 (3S). S11-S16. DOI 10.1016/j.semarthrit.2020.04.008.
7. Елисеев М.С., Новикова А.М. Коморбидность при подагре и гиперурикемии: распространенность, причины, перспективы уратснижающей терапии. Терапевтический архив. 2019. 91(5). 120-128. DOI 10.26442/00403660.2019.05.000232.
8. Merriman T.R. An update on the genetic architecture of hyperuricemia and gout. Arthritis Res Ther. 2015. 17 (1). 98. DOI 10.1186/s13075-015-0609-2.
9. Zheng M., Ma J.W. Research progress in the genetics of hyperuricaemia and gout. Yi Chuan. 2016 Apr. 38(4). 300-13. DOI: 10.16288/j.yczz.15-385.
10. Chen C.J., Tseng C.C., Yen J.H., et al. ABCG2 contributes to the development of gout and hyperuricemia in a genome-wide association study. Sci Rep. 2018. 8(1). 3137. DOI 10.1038/s41598-018-21425-7.
11. Nakatochi M., Kanai M., Nakayama A., et al. Genome-wide meta-analysis identifies multiple novel loci associated with serum uric acid levels in Japanese individuals. Commun Biol. 2019. 2. 115. DOI 10.1038/s42003-019-0339-0.
12. Кушнаренко Н.Н., Мишко М.Ю., Медведева Т.А., Витковский Ю.А. Полиморфизм гена АВСG2 у больных подагрой в Забайкальском крае. Комплексные проблемы сердечно-сосудистых заболеваний. 2019. 8(2). 77-86. DOI 10.17802/2306-1278-2019-8-2-77-86.
13. Мишко М.Ю., Кушнаренко Н.Н., Медведева Т.А. Анализ межгенных взаимодействий, предрасполагающих к развитию подагры в популяции русских Забайкальского края. Забайкальский медицинский вестник : электронное научное издание. 2020. 4. 96-109. DOI 10.52485/19986173_2020_4_96.
14. Елисеев М.С., Чикина М.Н., Гусева И.А., Желябина О.В., Самаркина Е.Ю., Коновалова Н.В., Варламов Д.А. Связь полиморфизма Q141K гена ABCG2 с эффективностью уратснижающей терапии у пациентов с подагрой (пилотное исследование). Современная ревматология. 2021. 15(6). 55-60. DOI 10.14412/1996- 7012-2021-6-55-60.
15. Peng Q., Lu Y., Lao X. et al. Association between OGG1 Ser326Cys and APEX1 Asp148Glu polymorphisms and breast cancer risk: a meta-analysis. Diagnostic Pathology. 2014. 9. 108. DOI 10.1186/1746-1596-9-108.
16. Das S., Nath S., Bhowmik A., Ghosh S.K., Choudhry Y. Association between OGG1 Ser326Cys polymorphism and risk of upper aero-digestive tract and gastrointestinal cancers: a metaanalysis. SpringerPlus. 2016. 5. 227. DOI 10.1186/s40064-016-1858-5.
17. Naganuma T., Nakayama T., Sato N., et al. Haplotype-Based Case–Control Study on Human Apurinic/Apyrimidinic Endonuclease 1/Redox Effector Factor-1 Gene and Essential Hypertension. American Journal of Hypertension. 2010. 23(2). 186-191. DOI 10.1038/ajh.2009.221.
18. Das S., Purkayastha S., Roy H., Sinha A., Choudhry Y. Polymorphisms in DNA repair genes increase the risk for type 2 diabetes mellitus and hypertension. BioMol Concepts. 2018. 9. 80-93. DOI 10.1515/bmc-2018-0008.
19. Кушнаренко Н.Н. Сердечно-сосудистые нарушения у мужчин с подагрой: клинические особенности, механизмы развития, прогнозирование [диссертация … док. мед. наук]. Чита.: ГОУ ВПО «Читинская государственная медицинская академия». 2012.
20. Кушнаренко Н.Н., Медведева Т.А., Говорин А.В., Мишко М.Ю. Роль изменений жирнокислотного состава мембран эритроцитов в формировании нарушений кардиогемодинамики у больных подагрой с синдромом инсулинорезистентности. Российский кардиологический журнал. 2018. 23(5). 49-55. DOI 10.15829/1560-4071-2018-5-49-55.
21. Ndrepepa G. Uric acid and cardiovascular disease. Clin Chim Acta. 2018. 484. 150-163. DOI 10.1016/j.cca.2018.05.046
22. Maiuolo J., Oppedisano F., Gratteri S., Muscoli C., Mollace V. Regulation of uric acid metabolism and excretion. Int J Cardiol. 2016. 213. 8-14. DOI 10.1016/j.ijcard.2015.08.109.
23. Дырхеева Н.С., Лебедева Н.А., Лаврик О.И. АР эндонуклеаза 1 – ключевой фермент репарации апуриновых/апиримидиновых сайтов. Обзор. Биохимия. 2016. 81(9). 1198-1216.
24. Chatterjee N., Walker G.C. Mechanisms of DNA damage, repair, and mutagenesis. Environ Mol Mutagen. 2017. 58(5). 235-263. DOI 10.1002/em.22087.
25. Bokhari В., Sharma S. Stress Marks on the Genome: Use or Lose? Int J Mol Sci. 2019. 20(2). 364. DOI 10.3390/ijms20020364.
26. Weber D., Stuetz W., Toussaint O., et al. Associations between Specific Redox Biomarkers and Age in a Large European Cohort: The MARK-AGE Project/ Oxid Med Cell Longev. 2017. 2017. 1401452. DOI 10.1155/2017/1401452.
27. Luo C., Lian X., Hong L., et al. High Uric Acid Activates the ROS-AMPK Pathway, Impairs CD68 Expression and Inhibits OxLDL-Induced Foam-Cell Formation in a Human Monocytic Cell Line, THP-1. Cell Physiol Biochem. 2016. 40 (3-4). 538-548. DOI 10.1159/000452567
28. Yan Z., Yuan Z., Ni J., Gu L., Shen Y. Crystal structure of the crenarchaeal ExoIII AP endonuclease SisExoIII reveals a conserved disulfide bond endowing the protein with thermostability. Biochem Biophys Res Commun. 2017. 490(3). 774-779. DOI 10.1016/j.bbrc.2017.06.116
29. Esadze A., Rodriguez G., Cravens S.L., Stivers J.T. AP-Endonuclease 1 Accelerates Turnover of Human 8-Oxoguanine DNA Glycosylase by Preventing Retrograde Binding to the Abasic-Site Product. Biochemistry. 2017. 56(14). 1974-1986. DOI 10.1021/acs.biochem.7b00017.
30. Lai Y., Jiang Z., Zhou J., Osemota E., Liu Y. AP endonuclease 1 prevents the extension of a T/G mismatch by DNA polymerase to prevent mutations in CpGs during base excision repair. DNA Repair (Amst). 2016. 43. 89-97. DOI 10.1016/j.dnarep.2016.03.006.
31. Ito H., Matsuo K., Hamajima N., et al. Gene-environment interactions between the smoking habit and polymorphisms in the DNA repair genes, APE1 Asp148Glu and XRCC1 Arg399Gln, in Japanese lung cancer risk. Carcinogenesis. 2004. 25(8). 1395-1401. DOI 10.1093/carcin/bgh153.
Resume

Objective. To study the frequencies of alleles and genotypes of the polymorphic locus T444G rs1130409 of the APEX1 DNA repair gene in patients with gout and to evaluate their association with the gout development in the Russian population in the Trans-Baikal Territory.

Materials and methods. 80 patients (69 men and 11 women) with gout were examined. The diagnosis of gout was made in accordance with the ACR/EULAR classification criteria, 2015. The control group consisted of 46 persons of the appropriate age. According to nationality all the subjects were Russians, born and living in the territory of the Trans-Baikal Territory. The material for the study was DNA isolated from whole peripheral blood leukocytes using the DNA-Express Blood kit (Litech, Russia). All patients were genotyped to determine the polymorphism of the T444G rs1130409 locus of the APEX1 gene. Statistical data processing was carried out using the Statistica 10.0 software registry. The correspondence of genotype distribution to the Hardy-Weinberg equilibrium was checked by χ2 criterion. Differences in the frequency of alleles and genotypes between groups were assessed by Pearson's χ2 test. To assess the association of genotypes and alleles with gout, high odds ratios (Odds Ratio, OR) were calculated with a 95% confidence interval (Confidence Interval, CI).

Results. In the study of T444G polymorphism of the APEX1 gene in patients with gout a statistically significant increase in the frequency of the homozygous genotype G/G (27.5% vs. 9%; χ2=6.3; p=0.01; OR=3.98; CI 95%=1.28 -12.4) were found. In the group of male patients with gout, there is a higher frequency of the mutant G allele compared to the control group (53.6% vs. 4%; χ2=5.66; p=0.01; OR=2.24; CI95%=1, 14-4.40) and a statistically significant decrease in the frequency of the T allele (46.4% vs. 96%; χ2=5.66, p=0.01, OR=0.45, CI95%=0.23-0, 87).

Conclusion. Differences were found in the distribution of allele and genotype frequencies of the APEX1 T444G rs1130409 polymorphic locus in patients with gout and healthy respondents. The presence of the G/G genotype G increases the risk of gout by 3.9 times respectively. In male respondents, the carriage of the wild-type (T) allele has a protective effect, while the carriage of the minor allele was associated with an increased likelihood of developing the disease. The data obtained indicate the possible role of the APEX1 T444G rs1130409 gene polymorphism in the pathogenesis of gout.

References
Автор 1Мишко Марина Юрьевна
Автор 2Кушнаренко Наталья Николаевна
Автор 3Медведева Татьяна Александровна
Автор 4Мироманова Наталья Анатольевна
Автор 5Караваева Татьяна Михайловна
Автор 6Гайдукова Тамара Владимировна